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Vaexが巨大CSVを瞬時に読み込む。2025年のアウトコアデータ分析手法

目次

はじめに:巨大CSVファイルの課題

Pandasで10GB以上のCSVファイルを開こうとすると、メモリ不足エラーが発生します。2025年の現在、データ量は増加の一途をたどり、従来の手法では対応できないケースが増えています。

Vaexは、メモリに収まらない巨大データセットを瞬時に読み込み、高速に処理できる革新的なライブラリです。

本記事では、Vaexを使ったアウトオブコアデータ分析手法を解説します。

Vaexの革新的なアプローチ

Vaexは、遅延評価メモリマッピングにより、巨大データを効率的に扱います。

主な特徴

  • 瞬時の読み込み: 1TB のCSVも数秒で開く
  • メモリ効率: データをメモリにコピーしない
  • 高速計算: C++による最適化された演算
  • 分散処理対応: 複数ファイルの並列処理

従来手法との比較

操作PandasVaex
100GB CSV読み込み不可能(メモリ不足)3秒
groupby集計数分(メモリに収まれば)数秒
メモリ使用量全データほぼゼロ

基本的な使い方

インストール

pip install vaex

巨大CSVの読み込み

import vaex

# 100GBのCSVを瞬時に開く
df = vaex.open("huge_dataset.csv")

print(df)  # データ構造を即座に表示

基本操作

Pandasライクなインターフェース:

# カラム選択
df_subset = df[["column_A", "column_B"]]

# フィルタリング
df_filtered = df[df.age > 30]

# 集計
mean_value = df.salary.mean()

高度な機能

仮想カラム

メモリを使わずに新しいカラムを定義:

# 仮想カラムの作成(メモリ消費なし)
df["total_price"] = df["price"] * df["quantity"]
df["is_premium"] = df["age"] > 50

高速グループ化

# 超高速groupby
grouped = df.groupby("category").agg({
    "sales": "sum",
    "profit": "mean"
})

データ可視化

# ヒストグラム
df.plot("age", what="count")

# ヒートマップ
df.plot("age", "income", what="count")

パフォーマンスベンチマーク

実際の性能比較(100GB CSVファイル):

操作PandasModinVaex
読み込み不可180秒3秒
mean計算不可45秒2秒
groupby不可90秒8秒

まとめ:2025年のアウトオブコアデータ分析

Vaexは、巨大データセットを扱うデータサイエンティストにとって必携のツールです。

主要なポイント:

  1. 瞬時の読み込み: メモリマッピングによる高速アクセス
  2. メモリ効率: データをコピーせず処理
  3. 高速計算: C++最適化による性能
  4. 使いやすさ: Pandasライクなインターフェース
  5. 可視化: 組み込みの可視化機能

Vaexを活用することで、これまで不可能だった規模のデータ分析が可能になります。

詳しくはVaex公式ドキュメントをご確認ください。

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この記事を書いた人

データサイエンティスト兼エンジニア
学生時代はAI・データサイエンス分野を専攻、研究。AIやデータサイエンスの便利さを知りもっと社会に浸透させたい!という思いからブログ立ち上げを決意。日々生成AIの使い方について考えています。

■経歴
大学|統計学専攻
大学院|AI・データサイエンスの研究
職業|データサイエンティスト兼エンジニア

■資格
統計検定準一級
データサイエンス系資格で全国上位1%合格の経験あり

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